En la version actual, se deben poner como productos separados: https://www.egafutura.com/tutorial/administrar-productos-stock-listas-precios

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Pata una de las próximas versiones, tenemos planeado ofrecer la funcionalidad de variantes. Te recomendamos darle Seguir a esta pregunta, para enterarte cuando este listo.

No se si es correcto, pero la manera que encontré es haciendo categorías y mediante los TAGS usar la categoría "madre" 

Si es posible, tanto la interfaz de usuario, como la base de datos se pueden personalizar según las necesidades de cada empresa.

En el caso de la base de datos, esto se puede hacer mediante campos personalizados:

• https://www.egafutura.com/glosario/campo-personalizado5
• https://vip.egafutura.com/post/ayuda-modificacion-personalizacion-y-creacion-de-campos-en-la-base-de-datos--5f4ad037f2036d46fc18ef455
• https://vip.egafutura.com/post/ayuda-descripcion-de-los-tipos-de-campos-disponibles-en-la-base-de-datos-de--5f10c1ff8e6e0575480d19995